Olá! Realmente na idade dele o ideal é descartar doenças do coração com o Ecocardiograma. Se não existir esse exame na sua cidade, vale a pena procurar em outros centros.
Para te acalmar, na idade do seu filho pode acontecer a perda de fôlego, que acontece na hora do choro intenso. Tente não dar muita importância para o fato quando ocorrer, se você validar o desespero a criança fica mais ansiosa e chora ainda mais, ficando mais roxa. Mas, não deixe de fazer o exame para descartar doenças congênitas do coração.